自从幽灵号战役之后，宇宙也终于是迎来了较长时间的安定。
这段时间里，海盗蛰伏起来，完全收缩了扩散在外的势力，让那些被海盗荼毒的星球几乎喘息，重新回到最初的生活状态。
但那些海盗工业留下的“伤痕”几乎永久性的留在了那些星球上，至少不是短时间之内能够恢复的了。
而在这次战役中，做出了“巨大贡献”的阿格里，因为在强磁环境下过载运行，芯片差点当场烧坏。。。不过或许是因为基于贾斯汀的同类型芯片制造的缘故，芯片才没有真正意义上的报废。
虽然需要一定的修缮，但多少也算是让他们看到了一点点修复的希望。
这个做出了重大牺牲的战士，并不会就这样彻底离开他们。虽然修好也需要很长一段时间便是了。
这一修，就是三年。
这三年里，他们小队的五神装甲最终宣布报废，在赛尔号的大多数领导层人物获得装甲升级的同时，他们的装甲也得到了升级。
瑞格和辛迪，在这次战斗之中，遭到了一定的创伤，或许已经不再适合参与战斗了，并由于他们类型合适，功勋充足，被调回了地球。
获得了无尽能源，重新焕发出生机和动力的地球，为了纪念赛尔号做出的卓越贡献，地球方决定制造更多的赛尔号，先后去探索更为广阔的宇宙，而瑞格和辛迪，便是被派回去参加新赛尔号的船长的训练。
而龙和辰在被修好，并穿上了全新的装备之后，便开始继续执行任务了。
赛尔号在航行的过程中发现了时空裂缝，到达了一个叫做“摩尔庄园”的地方，并带回来了名叫嘟咕噜和嘟噜噜的神奇生物，在到达宇宙之后，成功的变异成为了新的精灵。
而辰，则前去调查时空裂缝的原理等信息了。
另外，还有一条更为重磅的消息。
第一位他们之前只曾听闻过的传说中的星系守护神，帕诺星系守护神玄武巴斯特，苏醒了。
巴斯特的苏醒给宇宙带来了更多的变化，包括但不限于：双属性的精灵开始出现。
后面再有赛尔前往阿格里曾经到达过的月影花园的时候，他们发现了第一只双属性精灵，水与暗影系精灵，鲁迪，鲁尔蒂尼。
斯诺星的各个地方，都出现了雷击枯石现象，而一种火与电属性的精灵也在这次异变之中诞生，洛森个，亚格洛。
其他的双属性精灵还有草与超能系精灵里昂—克苏昂—克尔加德，水与超能系精灵乌索—乌索尔—乌索达等等。
另外，赛尔号也发现了另一个星系——传说中被白虎泰格尔守护的星系，罗格星系，并在罗格星系之中发现了一大群奇特的精灵——暴食一族，这一族群并不是单一的一种精灵，而是拥有超强食欲以及吞噬能量的特殊能力的精灵种族的合称。
还有，目前已知的第一只完成了超进化的精灵出现了。
在海洋星潜心修炼的远古鱼龙，最终在海洋星发现了远古鱼龙一族的圣物“龙王的鳞甲”，并依靠鳞甲完成了新一步的进化——鱼龙王！
不过后来据鱼龙王自己所说，自己这并不算得是超进化，完整的超进化应当可以领悟更加强力的技能，而当下鱼龙王只是变了外貌，实力也变得更强了些，和哈莫雷特差不多，处于一个“半步超进化”的程度。
另一边，阿格里进入维修状态之后，他的三只精灵们都离开了赛尔号。
并不是放弃了作为阿格里的精灵的身份，而是在这次的事情之中，他们真正意识到了自己实力的不足。
他们要寻求更高一步的突破。
鲁斯王前往海洋星，寻找刚刚完成超进化的鱼龙王，而魔焰猩猩则去了火山星，而丽莎布布则前往克洛斯星，一边照顾新生的小豆芽，一边在蘑菇怪的指导下变强。
总之就是。。这三年里，大家经历了很多，而阿格里都缺席了。
他是时候回来了。
“终于完成修复了啊。。这算不算阿格里欠我一个救命之恩？”
茜茜看着手中的芯片，摇头笑道。
阿格里的损坏比之前贾斯汀的更为严重，因为对于机器人来说，只要芯片不损坏，就不会出现真正意义上的致命危机，贾斯汀在被主炮轰击之后，芯片却幸运的完好无损，而阿格里这一次却是实打实的差点烧了芯片。
连茜茜都不敢相信自己居然在这么短的时间里就能够将阿格里的芯片修好。
通知了赛尔号的所有高层之后，茜茜便拿着芯片前往机械室内部的工厂。
为阿格里准备的全新的专属装甲就在这里面。
外形设计和他的“隐藏老父亲”贾斯汀的六翼猎手相差并不是太多，太阳能板的位置也几乎差不多，不过三对飞剑消失不见，而是用特殊材质制作的类似于披风一类的东西，看上去柔软，随风飘动，却拥有着张开力场的能力以及强大的防御能力，双臂上各有一个利刃，可以收回，释放时也不会影响双手的操作。
主武器。。是镶嵌在机体显示屏下方的一个十字架，摘下来能够释放出一杆光能长枪。
装甲的整体水平已经达到了守护神级别，这还是因为赛尔号的能力有限。
这套装甲的设计图，是由之前巴斯德存放在送给阿格里的芯片里面的“专属装甲”里面的。
将芯片放入机体之中，茜茜轻声说道。
“睡了这么久，该醒过来了。”
伴随着茜茜的呼唤，在众目睽睽之下，一道光芒从阿格里的显示屏上面闪过，用来放置身体的舱体缓缓落下，而身体直立，身后的披风无风自动，身上的各个能量板块也都亮了起来。
原本的“阿格里的身体”，如今，已经成为了“真正的阿格里”。
离线足有三年的阿格里，如今，终于重新站了起来。
远在海洋星，火山星，克洛斯星的鲁斯王，魔焰猩猩和丽莎布布都同时心有所感。
回去的时候到了。