朱棣诛杀完那些反对者后，出于泄愤，在接下来的几天里，又将建文帝在位期间制定的所有政策全部废除，甚至直接没有承认有建文这个皇帝，废除了他的年号，继续沿用朱元璋的年号，建文四年改称洪武三十五年，次年改永乐元年。
洪武三十五年九月，地方各州县皆已归附，天下已定。
这日早朝结束后，朱棣邀甘武在御花园商讨有关迁都的事。
甘武表示赞成迁都。
朱棣大喜：“武弟真是如此所想吗？”
甘武道：“天子守国门，君王死社稷，乃英明的君王所为。”
“哈哈”
朱棣见甘武和自己意见相同，心中甚慰。
朱棣想着迁都主要是因为新朝刚立，根基不稳，而应天又大都是建文旧臣，他们在这的势力根深蒂固，处在这样的环境里，朱棣总感觉有些不安。
而迁都北平就不会再有这些顾虑，那可是自己的老巢，自己在那苦心经营的二十多年，在那建都，有利于政权稳固，况且自己对那也有深厚的感情。
迁都北平是一件庞大且十分复杂的大事，还需要一个漫长的过程。
于是隔日的早朝上，朱棣为了提高北平的地位。将应天改称南京，同时改北平府为顺天府称北京并作为陪都，这也是向大臣们预示自己想要迁都的打算。
九月十九日，皇宫内烧毁的宫殿都已修葺完毕，朱棣决定将还在北京的家眷全部接过来，他将护送的这个重任交给了甘武的关宁卫。
朱棣还打算完成这个任务后，派甘武负责拱卫北京的防务以及负责北京都城的建设。
甘武犹豫了一下，最终还是向朱棣说出了自己想退隐的想法，并将朵颜三卫和关宁卫的兵符交了出来。
“武弟，你这是干嘛？”朱棣瞪大眼睛满脸疑惑。
甘武道：“陛下，臣如今功成名就，便想过过那普通人家的生活，享受一下人伦之乐。”
“现在新朝刚立，国事繁多，朕离不开你呀！还有那些建文遗孤日夜想行刺朕，让朕甚是头疼，武弟你忍心看着我们辛辛苦苦打下的江山，又被人夺回去吗？”朱棣一脸忧心忡忡。
朱棣见这还无法打动甘武，又说道：“关宁卫是你一手创建出来的，你若就此离开，恐军心不稳。”
就这样，甘武暂时打消了退隐的念头，带着关宁卫前往北京。
而朵颜三卫经过四年战争，由于没有人员补充，所以仅剩不到两万人，朱棣令其驻防在北方大宁一带，自行繁衍，并准其后代世袭，朵颜三卫自此慢慢退出历史舞台。
甘武带着关宁卫一路轻装北上，沿途尽是战争后衰败的景象，一场战争使刚刚从元末创伤中刚刚恢复过来华北地区的百姓，一时间又陷入苦难之中，不少人为了活命，远在他乡。
为了恢复华北地区的生产，朱棣下诏鼓励流民返乡，主动还乡者可以得到一块属于自己的土地，同时减免了华北地区三年赋税，还发放了农具和稻种，使这些百姓的日子稍稍没那么难过。
三天后，甘武路过淮河，河流两边还漂浮着那场大火焚烧后留下的战船肢体，河水里还有浓浓的血腥味。
据说后来当地的居民好几年都不敢吃这河水里的鱼。
甘武勒马停下，河水激起的浪声，仿佛是那些不甘死去的南军士兵在向甘武发起索命。
甘武手上沾有数十万人的鲜血，可谓是当世杀神，从前的甘武杀的都是外敌分子和那些民族败类，可如今这数十万却是自家同胞兄弟，他们并没有错。
甘武不禁胸中难受，喃喃低吟道：
“泽国江山入战图，生民何计乐樵苏。”
“凭君莫话封侯事，一将功成万骨枯。”
甘武用这首唐末诗人曹松的诗表达了自己此刻的感受与无奈。
“等我百年之后，把我的骨灰撒在这河里，你们变成鱼来吃了我吧！”说罢！甘武率兵继续往北而去。