刀剑帮助百合子一行人突出了重围，并暗中跟随了百合子返回了日本，百合子一行人开始进行了葬礼的仪式，而刀剑和初音未来则是跑到了一处街道上，解除了光学阻断。
刀剑问道：“不知道神罗心灵研究中心的位置在哪里。”
初音未来说道：“听紫说，好像是在这个空间中日本的西贺县。”
刀剑说道：“西贺县吗？那么我们马上出发，也许能搜索一点什么信息呢。”
刀剑和初音未来搭乘列车，此时在列车上对话着。
初音未来说道：“刀剑，你觉得紫所说的百合子的有缘人，会不会真的是你啊？”
刀剑回答道：“这个嘛……很难说呢，她遇到我并不代表我就是她的有缘人。我想进入神罗心灵研究中心，也许就能找到答案吧。”
之后刀剑和初音未来两人来到了西贺县，依靠互动扫描仪找到了神罗心灵研究中心，刀剑说道：“初音姐姐，这栋大楼就是神罗心灵研究中心。”
初音未来说道：“不过这个地方对升阳帝国来说可是个机密场所，我们该怎么进去比较好？”
刀剑拿出了两个隐身斗篷，其中一个给了初音未来，说道：“拿好这个，这个是隐身斗篷，记住，在隐身的时候绝对不能离开我的身边，另外，我现在要用出入洞口这个道具进入，进去的时候特别注意里面的人的情况。”
初音未来点了头，两人一同穿越了出入洞口潜入了神罗心灵研究中心，并披上了隐身斗篷。开始探索研究中心的情况。首先他们来到了保安与管理区。
此时刀剑和初音未来在一个房间找到了一份损伤报告。说道：“这个是……报告吗？”
初音未来仔细阅读说道：“这是有关百合子上次因为在这里造成的破坏，而且破坏的东西很贵的呢，总共有……好几十亿日元呢。”
刀剑说道：“好贵啊，一般人可是买不起的呢，不过这里也有许多地方是用纳米钢化材料铸造而成的，虽然比不上未来世界的记忆金属，但足以抵挡大部分的攻击。但也有极少数的东西是抵挡不住的，比如涅法雷姆之力，核子武器，还有十香姐姐的鏖杀公……等等。”
初音未来说道：“听紫说过，这个空间是没有核子武器的。”
刀剑回答道：“那都是因为苏联的查丹科总理为了改变命运，利用了时间机器谋杀了爱因斯坦，就这样因为历史的改变造成了这个空间没有核子武器。”
初音未来说道：“是吗？”
刀剑说道：“与其说这些，我们还是找到其他的资料再说吧。”
刀剑和初音未来在隐身的状态下探索，找到了一份秘密档案和一些弓箭装备。
刀剑说道：“初音姐姐，你看，这些是弓箭装备，好像也是纳米钢化材料铸造而成的，不过这些弓箭不知道有什么用处……”
初音未来思考了一下，说道：“我明白了，有一群神秘的女子部队，没有被编入火箭天使的队列，但是她们以高超的弓箭技术，发射的都是雷射导引的穿甲飞弹，而不是传统的弓箭，这种东西不仅能杀伤步兵，而且还能有效对付飞行器和轻装甲。”
刀剑此时拿了其中一把纳米钢化弓，取走了几十枝穿甲箭，收进了百宝袋中。
初音未来说道：“刀剑，你拿走它有什么用意吗？”
刀剑回答道：“我想把它带走，回去的时候可以试一下这把弓的威力。”
初音未来点头道：“好吧，千万别被这里的人发现了。”
在两人的探索下，刀剑和初音未来又找到了一份档案，刀剑说道：“初音姐姐，这里也有一份有关于百合子姐姐的信息呢。”
初音未来看了一下，说道：“这份档案……好像是岛田博士要找百合子的精神伤害和肉体痛苦程度的临界点吧……”
接着刀剑和初音未来来到了纳米科技实验室，此时发现了几个正在转动的塔。
初音未来说道：“这是什么啊？刀剑。”
刀剑回答道：“我也不知道。”
初音未来指着转动的塔附近的档案说道：“快看，有档案！”
刀剑和初音未来跑了过去，查看了一下，刀剑明白道：“原来如此，这个东西叫做超能波抑制装置，他们想要百合子姐姐进入这个装置的范围，使百合子姐姐无法运用她的超能波能力。不过建造这种装置耗费了很大的精神呢……这个东西是虽然昂贵但比较脆弱的一个装置。”
初音未来说道：“那么百合子遇到这个东西的时候不就……”
刀剑回答道：“不要紧的，我们会暗中帮助她的。”
初音未来点头道：“是啊，我们可是接受紫给的信息才要去的呢。”
再来刀剑和初音未来来到了拘留与复制区，却在一个仓库里发现了很多的裙子。
刀剑说道：“初音姐姐，这里为什么会有这么多衣服呢？”
初音未来找到了一份档案，说道：“我找到洗衣单了，不过他们好像订购了两千件彩格裙，不过为什么会买这么多呢……”
刀剑回答道：“这些彩格裙好像是像百合子姐姐这样的才能穿吧？”
初音未来此时笑道：“其实我也想穿一下这样的裙子，不知还有没有机会。”
刀剑说道：“回去再买不就可以了，像这样的款式倒是挺多的呢。”
然后，刀剑在一处牢房中找到了一份报告。刀剑说道：“初音姐姐，快看，是百合子姐姐的姐姐宫本野泉的一份报告。”
初音未来说道：“宫本野泉？我看看……”
初音未来拿到了刀剑给的报告，说道：“宫本野泉……生存力平均a＋，专注力平均b＋，纪律平均a－，力量平均s。”
初音未来明白道：“这是野泉过去的成绩，好像是他们测试野泉的能力吧。”
之后，刀剑和初音未来两人跑到了鬼王测试与调整室，却发现了和百合子一模一样的人被关在大盒子里。
刀剑说道：“初音姐姐，好多的百合子姐姐。”
初音未来明白道：“我明白了，他们一定是在执行欧米茄计划，以百合子身上的基因来复制许多的克隆人。”
刀剑此时说道：“可恶，居然在这里复制百合子姐姐，在道德上是绝对不允许的。因为肆意乱创造人体生命，扰乱了其他生物的生理结构。”
初音未来说道：“是啊，看来这一切都是岛田博士的错，把百合子弄成了那个样子……”
刀剑说道：“看来我们有必要让百合子姐姐报复一下了。”
初音未来此时听到了声音，说道：“刀剑，那边好像是会议室，我好像听到了什么呢。”
刀剑回答道：“你带我去看看，也许能听到什么信息呢。”
刀剑依照初音未来的听觉的方向的指示，找到了会议室，此时会议室里的大吵大闹也引起了刀剑的注意。
初音未来说道：“就是这里。”
刀剑说道：“这个是……有人在这里吵架呢。”
初音未来说道：“听听他们在说什么呢。”
刀剑说道：“好，隔着门听听看吧。”
刀剑和初音未来同时隔着门用高深的耳功听到了一个男子和一个女子的对话。
一女子愤怒质问：“岛田博士，难道你觉得你害死的人还不够多吗？”
刀剑此时说道：“初音姐姐，岛田真司博士就在这里！”
初音未来点了头，说道：“嗯，再听听看！”
岛田真司恼羞成怒，说道：“这……这是达郎王子和天皇的决定！”
那女子愤怒的嘲讽，说道：“决定？哈哈……恐怕这只是你个人的决定吧，岛田博士！你不要忘了，你今天的荣誉和地位，都是用那些无辜生命的牺牲换来的！难道这还不能满足你自己的贪欲吗？”
岛田真司站起来，愤怒地大声喊道：“你…你这个疯女人，你难道想丢掉你现在的工作吗？”
那女子说道：“喔～那我很愿意！”说着就扯下自己的工作证，并脱下了自己的白色工作服，都扔在了地上，说道：“岛田博士，从今天开始，我正式退出欧米茄计划研究小组！”
岛田手指着女子，气得说不出话来：“你……你……”
刀剑说道：“初音姐姐，先让一边吧，有人要出来了。”
初音未来点了头，只见到那女子愤怒地走出来，用力把会议室的门关上。可是那女子想走出神罗心灵研究中心，却遭到了近卫部队的阻拦。
那女子惊道：“你们想干什么！”
近卫部队其中一人说道：“佐藤高崎，你涉嫌散布危害国家，指责天皇的言论，我们现在立刻要把你逮捕！”
刀剑此时对初音未来说道：“初音姐姐，我们出手吧！”
初音未来说道：“嗯！”
刀剑和初音未来在隐身的状态下，向近卫部队所有人出手，每个人各是被一掌打到了后脑勺，所有的近卫部队的人都昏在了地上。
佐藤高崎惊讶了：“这是怎么回事？”
刀剑和初音未来同时把隐身斗篷揭了下来，在佐藤高崎的背后出现。刀剑立刻向佐藤高崎说道：“你已经没事了，这位阿姨。”
佐藤高崎说道：“你们是？刀剑……还有未来吗？”
初音未来说道：“咦？你们怎么认识我们啊？”
佐藤高崎突然说道：“刀剑，你叫别人阿姨实在是太失礼了吧？叫我姐姐才行啊，毕竟我喜欢十七这个数字呢……”
初音未来说道：“十七……莫非你是？”
刀剑惊道：“你是八云紫小姐？”
八云紫揭下了佐藤高崎的伪装，自己出现在两人的面前。刀剑惊道：“八云紫小姐，没想到你用易容技术混入了神罗心灵研究中心？”
初音未来说道：“你难道这几天一直都在这里卧底？”
八云紫说道：“是啊，那么……百合子的事情怎么样了？”
刀剑回答道：“百合子姐姐她差不多要攻进来了……”
过一会儿“轰隆”的一声，神罗心灵研究中心突然响起了警报，刀剑说道：“来了，百合子姐姐她来了！”
八云紫急忙说道：“快隐身吧，这里的人马上就要到了。”
刀剑和初音未来重新披上隐身斗篷，而八云紫说道：“两位，祝你们好运。”
说完八云紫躲入裂隙，消失在神罗心灵研究中心。松井百合子的突然出现，使得刀剑和初音未来感到一股紧张，不知该如何帮助百合子呢？下章分解。