9、丹药：丹药嘛，本质上就是药，药，本质上就是用来治病的，但这里的丹药已经和外丹术里面的丹药有了根本的不同。人会死，本质是有病，所以不能长生，治病则非药不可。这里讲了时病、年病和身病三种病，时病和年病大约就是人的各种普通疾病，这里也包括老死，那是可以用一般的草药、外丹治疗的。身病则不同，只能用内丹来治疗了，所以内丹就是成仙的关键了，前面讲那么多，无非是为开始修炼内丹做的准备，下面就开始了修炼功法。
虽然钟吕是否定外丹的，但在这里也说九品大丹并非不可用，不过要先清心固肾，也就是把心、肾先炼好了才可以吃，对于辅助龙虎交媾而成黄芽是有作用的。
10、铅汞：龙虎交媾以后可采黄芽，黄芽就而分铅汞。前面讲过外丹的铅汞，内丹里的铅汞又是什么呢？铅是来自父母的真气，是先天的元阳之气，是收在肾里的。为什么是在肾里？肾为水，水是生命之源嘛，易经里也讲天一生水，就是这个道理。汞呢，本来是心液中的正阳之气，但这个气本质上也是来自肾，肾气传给肝气，肝气传给心气，心气生液藏正阳之气，这就是汞，也就是说肾气负正阳之气，即阴留阳，用阳炼阴，气变为精，精变为汞，汞变为珠，珠变为砂，砂变就成就金丹。
比较复杂，展开讲这些也不现实，还是有机会再交流吧。理解起来也不难，就和修真小说里讲的差不多，金丹炼成了，就成了金丹高手，此时真气自生，已经是超脱凡人的存在了。
11、抽添：实际上前面讲的都是基本的术语、理论，下面才是具体的修炼功法，先看抽添。
抽添抽的是铅，添的是汞，就是从肾中抽铅添心中之汞，由于是从下丹田入上丹田，所以叫肘后飞金晶、起河车、走龙虎，不管叫什么吧，添的是汞，是正阳之气，干什么呢？炼精、气嘛，还精补脑才是最终的目的。
这里同样需要逆转五行，为什么非要逆呢，前面讲过，顺成人，逆成仙嘛，当然了，这个理论是后面的陈抟总结出来的，但前辈们早就在用了。按照道家理论，五行不颠倒，龙虎就不能交媾，三田就不能返复，这样周天不转，哪里还谈得上结仙胎。
一般来说，抽添一百天就可以全药力，二百天坚圣胎，三百天就能生真气了。有了真气，就如果修真小说里讲的感觉到真气存在了，就可以在经脉里流转了，接下来才可以炼气，当然钟吕的功法是忘形而胎仙自化，就是成仙了。
12、河车：什么是抽添，抽添的目的是什么知道了，那么肾水、心火是如何在体内走的，这就是河车的事了。前面讲到，体内水多火少，或者说基本上哪都有水，所以搞运输这事水运最适合了。水通八方，什么四海、三田、八琼、九州，哪都能到，这就是河。水路有了，还需要船，不过这里叫车，但这个“车不行于地，而行于水”，所以叫河车，您要问为什么不干脆叫转河舟，这我还真说不清，假如体内火多，那么就可能是转火车了，转火舟似乎就不合理吧，玩笑。
实质上，这个河车就是肾中真气，不是说了，有了真气就可以在经脉里跑了嘛，当然不能空车白跑，龙虎相交要它搬运，养阳炼阴要它搬运，总之只有它才可以让体内动起来，所以转河车就成了重要的修炼功法，功法好的，装的多，跑的快，修炼就如坐火箭，功法差那就完了，慢吞吞打坐一晚上都转不了一圈，那还修什么仙啊，这就是以前所讲的资质上不同，修仙的结果也会不同。
当然，钟吕把河车又分成小河车、大河车和紫河车，这不是车跑的速度的问题，而是指修炼的不同阶段的区别，比如龙虎相交阶段是小河车，抽铅添汞是大河车，而大药成了以后就得用紫河车了。
13、还丹：还丹是更重要的功法了，这里的丹实质上就是丹田里的精气神三宝。还丹功法有很多种，诸如小还丹、大还丹、七返还丹、九转还丹等等，但最重要是金液还丹和玉液还丹。玉液就是肾液，是随元气上升的，实际上就是去补金液，“举之而满玉池，散而为琼花，炼而为白雪”，行功路线是从中丹入下丹田和从中丹田入四肢两条，一是炼药，一是炼形，形神兼修。
金液就是肺液，肺属金嘛，具体功法不再多讲了，金液是在大药将成时才会用到，肘后飞金先入上丹田，再至中丹田，最后还下丹田。
14、炼形：玉液还丹可以炼形，可以理解为修真小说中所讲的体修功法，就是从中丹田到四肢的还丹。炼形目的是为了固神，这是性命双修的理论了。炼形主张对内“消形质之阴”，对外“夺天地之气”，就是想办法吸收天地灵气，锻炼肉身，壮大阳气。
具体功法讲得也比较细致，比如始于肝，次于心，次于脾，次于肺，次于肾。
当然，还有更高级的金液炼形，那是可以把骨头都炼成金色，出场自带黄金光圈的最高级炼形功法了。金液炼形后才可以修成五气朝元，三阳聚顶的纯阳的超凡体，那才是龙飞体内，鹤舞项中，三千功满，不为尘世之人，已作蓬瀛之客的天仙之路。
15、朝元：前面总说五气朝元，修真小说里也常用这个名词，什么是五气，什么是朝元？前面讲过五气就是五脏之气，元是就是丹田，分上中下三丹田，气聚神守丹田就叫朝元。
三个丹田是不同的，前面讲《参同契》时提到过，道家对子时、午时很重视，因为那是一阳初生和一阴初生之时。一阳初生之时，五脏之气朝于中元，这就是五气朝元；
一阴初生时，五脏之液朝于下元。
神就是体内真阳，真阳也不止一种，有阴中之阳，有阳中之阳，还有阴阳中之阳，这叫三阳。三阳要向上返丹田，就是心神要上返天宫，也就是所谓的三阳聚顶的意思。
具体功法也不多讲，大体就是要纯阳之气炼五脏之气，先做到肾无阴，九江无浪，然后肝无阴，八关永闭，接着肺无阴，金火同炉，再就是脾无阴，玉 户不开，最后是四气聚而为一，水火相包，以入神宫，炼神成仙以合大道，所以朝元已经是极高深的境界了。
16、内观：钟吕的内观继承了坐忘，本质是相同的，不过钟离权说他的内观更丰富，更高级，表现在除了观想那些阴阳之物以外，还包括五岳、四象、九州、四海、三岛、重楼等等，当然以后没准还会再增加，功夫是发展变化的。
17、魔难：修真小说或者武侠小说里经常讲修炼什么绝世武功时，经常会有走火入魔的桥段，这其实是道家最为重视的部分。钟吕早就有了全面的总结，有十魔九难，它们实质上就是影响修炼的各种欲望、幻象等等，比如九难中的衣食、恩爱、名利、灾祸等等，十魔有大三类：身外、梦中和内观之魔，细分包括六贼魔、六情魔、富魔、贵魔、女色魔等等。
魔难是阻碍修行的，但有魔难并不可怕，如果没有磨难那谁都可以修炼成仙了，只要“急起三昧真火以焚身，一挥群魔自散”，当然说着简单，做着难，为什么要坐忘啊，还不是因为魔难？
18、证验：修炼了几个月甚至几十年了，自己修行的到底对不对，功力到哪一步了，离成为天仙还有多远啊，这就是证验的作用了。内丹修炼，法有十二科，包括匹配阴阳、聚散水火、交媾龙虎、炼炼丹药等等，依法循时，逐阶修炼，证验次序，无差毫末。证验可以通过修行中出现的不同反应和现象，判断并确定修行到哪里了，是否出了问题等等。各种证验的具体反应有惊汗、行止如飞、疗人疗病等等，罗列得非常详细，参照着修炼，就可以心中有数，这样才能够更加安定心神，具体功法在《灵宝毕法》中讲得比较详细，不再多说。
这十八论可以说是对钟吕内丹的一种总结，当然施肩吾认为只有这十八论还稍显不够，于是又总结了一部《百问篇》，同样是用对话的形式，对内丹修炼中的一百个重要问题进一步加以讲解，内容相当丰富，别说，做得还真贴心。
钟吕的内丹功法还有一部重要秘笈《秘传正阳真人灵宝毕法》，简称《灵宝毕法》，主要是讲渐次修炼的三乘丹法，包括红铅、黑铅、金液、玉液，各种还丹功法等，对应了《钟吕传道集》最后“证验”中的十二科。十二科又分为十门，其中第六科玉液还丹和第七科玉液炼形合为一门，第八科金液还丹和第九科金液炼形合为一门，故共有十门。
1、小乘丹法，可安乐延年，是人仙的修炼功法，共有四门：匹配阴阳、聚散水火、交媾龙虎和烧炼丹药。
2、中乘丹法，是修炼地仙的功法，共三门：肘后飞金精、玉液还丹法和金液还丹法。
3、大乘丹法，是仙炼天仙的功法，共三门：朝元法、内观法、超脱法。自下升高，内景真虚，渐入希夷之域，得灵宝妙理入圣超凡。
《灵宝毕法》中的功法讲得更加具体详细，包括时辰、姿势、行功路线、方法，以神炼气的有为法，以气炼神的无为法，神灵相合的无不为法，每一门修炼的效果等等，需要说明的是，功法方面处处都透着《参同契》的影子，比如天道观、药物论、火候说等等。
仅通过这两部典籍的部分内容来看，可以说钟吕的内丹理论体系已经极为完善了，精微透彻程度在当时可以说已达极致，所以宋、元内丹派南北二宗和东西两派才甘心尊奉二人为始祖。