第二次马其顿战争之后，马其顿王国实力大降，位于波斯地区的塞琉古王朝看到机会，趁机攻占了小亚细亚的一些地盘，然后继续向西攻入色雷斯，准备借机消灭马其顿。塞琉古的侵略行为很明显与罗马的东扩理念是冲突的，这让罗马元老院决定，必须攻打塞琉古。从公元前192年起，到公元前188年，罗马一度和马其顿联盟，与塞琉古王朝展开了战争。双方在小亚细亚的马格尼西亚发生会战，塞琉古王朝大败。
击败了塞琉古王朝后，腓力五世获得了一些好处，马其顿夺取了色雷斯、帖撒利亚、波哈比亚和阿塔玛尼亚地区的一些城市，在希腊城邦的影响力重新扩大。罗马当然不会希望一个强大的希腊强权重新出现，于是罗马人又继续与埃托利亚人达成同盟，以此扼制马其顿的扩张。在色雷斯内部则出现了亲马其顿派与反马其顿两派，结果反马其顿派去了罗马元老院控告腓力五世，元老院于是作出裁决，腓力五世必须撤出色雷斯。
腓力五世心不甘情不愿地服从了罗马元老院的裁决，但是心里对罗马的不满日益剧增，新仇旧恨加在一起，腓力五世暗暗积蓄力量准备伺机而动。公元前179年，壮志未酬的腓力五世去世，长子百尔修斯继位。百尔修斯是个雄才大略的君主，他励精图治、厉兵秣马，并且娶了塞琉古王朝的公主劳迪斯为妻，改善了与塞琉古王朝的关系。与此同时，百尔修斯也尽力修补和希腊各城邦的紧张关系，以获取尽量多的朋友。百尔修斯所做的一切就只有一个目的，那就是准备重新对罗马同盟发起战争。罗马人则冷眼密切关注着百尔修斯。
公元前171年夏，意识到百尔修斯的野心越来越大的时候，罗马人进行了战争准备，两个兵团及一支50艘战舰的军事力量进驻阿波罗尼亚。但是对于准备充分的百尔修斯，罗马人的战争动员略显不足，罗马人采用了“拖”字诀，他们主动与百尔修斯谈判的同时，国内则继续动员战争，政治手段稍显稚嫩的百尔修斯错失了发动战争的最好时机。等到战争动员完全充足后，罗马人停止了谈判，于11月主动向马其顿宣战，第三次马其顿战争爆发。
战争前两年，双方互有攻守，百尔修斯取得了一定的优势。两年之后，罗马人逐渐取得战场上的主动，他们攻入了马其顿本土，公元前168年6月22日，双方在彼得那展开会战。会战开始初期，马其顿方阵取得了优势，他们击溃了罗马人的前锋，罗马人被迫退到军营附近的高地上，希腊人尾随攻击，但是由于地势不平，马其顿方阵不得已变阵。看到马其顿方阵出现漏洞，罗马人趁机钻进马其顿方阵的空隙与希腊人肉搏，近身肉搏是罗马人的拿手好戏，马其顿方阵大乱，罗马人把握住有利时机，从侧面和后方包围了希腊人，希腊人终于溃败。此战过后，马其顿战死人，被俘超过1万人，百尔修斯在逃亡路上被罗马人生擒，然后杀死。
对于战败的马其顿，罗马人将其一分为四，采取了高压政策。罗马规定四个城邦之间不得通婚、来往与贸易，同时也不准与希腊其他地区进行联系。
公元前152年，安德里斯库斯试图重建马其顿王国，他自称是百尔修斯之子，公开反抗罗马。第二年，梅特卢斯率领罗马大军前往马其顿，第四次马其顿战争打响。罗马大军很快便将安德里斯库斯歼灭，但是不久之后，又陆续冒出了两位百尔修斯之子，经过两年时间的围剿，叛乱最终被平息，马其顿成为罗马共和国的一个行省。
公元前147年，希腊中部与南部爆发了以亚该亚同盟为首的反罗马同盟。相对于此时的希腊同盟来讲，罗马人在军事上的强悍已经足以碾压他们，一年时间，罗马人轻松地战胜了希腊人同盟，科林斯被毁，居民成为奴隶，中希腊和南希腊并入罗马，设置为阿卡亚省。整个希腊就只剩下斯巴达、雅典等极少数城邦保持了名义上的自治。
希腊人终于为他们的“短视”与“追求自由”付出了沉重的代价。