正统八年六月中旬，皇上急调于谦回京，此时朱祁镇与代王朱桂之间的对抗，已经略有优势。皇上这个时候要考虑，办了代王之后，要如何改革大同的军政了。大同的情况和辽东还有些不一样。
辽东面对的外敌，强度没有大同的大，而且最根本的区别是，辽东人少地多，而大同却恰恰相反。作为一个传统边镇，大同一直都是华夏文明与草原文明激烈交换意见的窗口。从北元时期一直到瓦剌，大同几乎就是双方交换意见的主战场。
洪武到永乐时期，大同常驻守军有十三万人左右。到了仁宣两朝，朝廷采取收缩政策，大同的明军多被调往京师或南方，加上朱老四北征消耗太大。仁宣采取休养生息，又复原了不少士兵。
到正统四年，朱冕上任不久，清点大同守军，此时的大同总兵力才刚刚三万人。由于当时大同刚才开市不久，朱冕上奏皇上，以保卫边市的安全，又新募了一万一千兵。此时大同已经开始出现军屯的耕地被占，卫所的军户成为流民的情况。
大同一共十四个卫，总兵力才三万人，平均一个卫连一半的编制都没有达到。没有土地就养不了那些军户，没有卫所军户，就没有粮草和后备兵员。一旦也先在西边取得了战果，必然会重新回到中部主战场。
就现在大同这区区四万人，能跟也先打几回合呢？蒙古人最擅长的就是在一群猎物中发现并攻击那个最弱的。现在也先能面对的宣府、大同、宁夏、甘肃四镇，大同说自己是倒数第二，没人敢说自己是倒数第一。
八月，朱桂已经在与朱祁镇的拉扯中，彻底失败，清退出来了187万亩的耕地。其中侵占卫所军户的耕地就有六十多万亩，清退的土地全部用于安置大同的流民都还有富裕。这时候就该于大人出场了。
于谦回到兵部述职之后，抽空把自己在辽东改革军制及未来发展方向，全部总结了出来，给皇上上了一封《经略辽东志》。朱祁镇看了之后，非常满意，单独与于谦商谈多次。最终形成文本《经略辽东周知册》，发往辽东。
这几乎是定下来了未来十年辽东的发展动向。别人不知道，但是朱祁镇知道，上辈子自己还在留学瓦剌期间，于谦就对繁杂疲冗的京军进行改革，史称“团营”改革。所以朱祁镇是知道于谦的能力的。
派于谦去辽东，也是给他一个实战的空间积累经验。毕竟当时辽东的战争强度不大，于大人有的是回旋余地。然而仅仅不到三年时间，于大人就把浑河以南的土地纳入了大明实际控制范围内不说，还干灭了福余卫。
如果要给于大人在辽东打个分的话，满分一百，于谦至少可以得一千。
现在朱祁镇要把完成收割之后的大同拿给于谦打理了，虽然大同现在的情形几乎是天胡开局，但是于大人这次将面对的是：更强大的敌人和更紧迫的时间，
朱祁镇在武英殿单独召见了于谦，“于大人，现在代王清退出来的土地还可以再安置五六千户百姓，朕想从河南再迁部分百姓过去，不知可否。”
“陛下，臣认为现在还不宜迁徙中原百姓去边疆，大同府还有大量的土地被卫所的军官占有，只有把这部分土地清退出来了之后，才可考虑迁徙百姓之事。”
“那于大人有什么办法，解决这些被占的屯田呢？”
“臣认为，还是要摆脱兵农合一的政策，首先需要重新清丈军屯的耕地。然后卫所军屯的土地按照官衔等级重新分配，多占有的土地直接用白银赎回。”
“这样下去，还是改变不了土地的兼并啊。”
“陛下，一旦重新划分土地之后，臣的意思就彻底的取消军屯，所有卫所的耕地都属于农户耕地，每年向朝廷上交税粮即可。”
“那卫所的兵怎么办？”
“兵农分离。臣在辽东仔细观察过，卫所兵看似数量很多，其实其中有战斗力的不足十之一二。不如让那些老弱就以耕种为主，只需每户的精壮入伍即可。”
“那这些精壮是编入卫所军的编制吗？”
“臣认为以后无需再有卫所兵和募兵之分，所有精壮都以募兵入伍。只是军中主力需安排大同本地有耕地的士兵担任，因为这些人的战斗力和忠诚度是有保障的。”
“嗯~于大人的政策果然是高瞻远瞩。那如果这些军户的精壮都入伍了，那家乡的土地谁来耕作呢？谁也不能保证每户都有二三壮丁吧。”
“这就是下一个问题了，如果这些士卒的土地没有足够的劳力耕作的时候，可以雇佣其他的农户帮忙。等整个大同土地全部清丈、分配完成之后，剩余的土地就可以分配给其他地区的流民或者迁户来耕作。让他们分配的土地略少于卫所的军户，这样他们就会有欲望和精力，去帮工。”
“先生的决策，如同秦国商鞅变法之后，召请大量六国百姓移民秦国。让六国百姓耕作秦人土地，而老秦人则负责上阵杀敌。”
“皇上英明，臣就是借鉴商君的政策为基础。当地的官员可以安排新迁至大同的百姓帮助原来的那些军户耕作，收成之后除去税粮，分给雇佣农户七成的收成。这样双方都有利可图，大同的根基才会稳定。”
“那先生对大同镇现在的兵力部署有什么安排吗？”
“现在的兵力应该不足以抵挡住瓦剌未来的攻势，三万卫所兵中能有一万精壮留下就不错了，剩下的都得重新招募训练。臣认为大同的守军至少要保持在六万人左右，才能抗衡瓦剌的寇边。”
于谦的分析头头是道，皇上非常满意。这可不是纸上谈兵，于大人的能力是经受过时间的考验的。在军事制度的改革上，于谦几乎是天花板级的存在。
回想起上辈子，迫于无奈，最终对于大人还是下了杀手。无论是对自己还是天下，都是一个不幸的结局。所有的起因都是土木堡一役。每当回想到当时的场景，朱祁镇还是会脊背发凉、额头冒汗。直到现在“土木堡”依旧是他挥之不去的阴影。
大同，在朱祁镇心中，永远是最重要的一个地方。八月，王振在大同刚清丈完代王的家产，朱祁镇就命于谦为大同巡抚，前往了大同。